ФГБУ «Федеральный экспертно-правовой центр агропромышленного комплекса» (ФГБУ «ФЭПЦ АПК») было создано в 1998 году, как Правовой центр АПК, в целях осуществления правового обеспечения деятельности организаций агропромышленного комплекса и участия в подготовке проектов федеральных и отраслевых нормативно-правовых актов.

Учредителем ФГБУ «ФЭПЦ АПК» является Министерство сельского хозяйства Российской Федерации. Координацию деятельности Учреждения осуществляет уполномоченный в установленном порядке Департамент правового обеспечения Минсельхоза России. 

С 2006 года с учетом приобретенного опыта и наработок ФГБУ «ФЭПЦ АПК» успешно оказывает юридические и консультационные услуги сети организаций, подведомственных Минсельхозу России, сельскохозяйственным товаропроизводителям, иным организациям агропромышленного сектора.

Учреждение осуществляет свою деятельность на всей территории Российской Федерации и взаимодействует с федеральными органами исполнительной власти, органами исполнительной власти субъектов РФ, органами местного самоуправления, общественными объединениями, иными организациями и гражданами.

С начала 2013 года ФГБУ «ФЭПЦ АПК» начало новый этап развития, получив новое наименование и стратегический план развития, который предусматривает шестикратное увеличение выполняемых государственных работ (услуг) и развитие внебюджетной деятельности. Сегодня ФГБУ «ФЭПЦ АПК» призвано создавать правовые условия, способствующие развитию агропромышленного комплекса России, в том числе в новых условиях членства во Всемирной торговой организации.